عملکرد یک خردکن زباله پزشکی در درجه اول در راندمان خرد کردن و اندازه ذرات خروجی آن منعکس می شود. آزمایش عملکرد معمولاً ظرفیت پردازش تجهیزات را با وزن کردن مقدار زباله پردازش شده در واحد زمان و به طور همزمان نمونه برداری و اندازه گیری ذرات زباله خرد شده برای اطمینان از یکنواختی و اندازه مطابق با الزامات طراحی ارزیابی می کند. این آزمایش همچنین سایش ابزارهای برش و منطقی بودن طراحی محفظه خرد کردن را تعیین می کند، بنابراین عملکرد کارآمد در استفاده واقعی را تضمین می کند.
در طول آزمایش، پایداری عملیاتی تجهیزات نیز باید کنترل شود، از جمله بار موتور، نوسانات سرعت، و سطوح نویز. یک خردکن با کارایی بالا باید در طول کارکرد طولانی مدت، بدون لرزش بیش از حد یا آلارم اضافه بار ثابت بماند. به طور همزمان، عملکرد دستگاه‌های ایمنی، مانند دکمه‌های توقف اضطراری، قفل‌های محافظ درب، و عملکردهای حفاظت از اضافه بار، برای اطمینان از خاموش شدن سریع در شرایط غیرعادی و محافظت از ایمنی اپراتور، باید آزمایش شوند.
پاکیزگی و عملکرد زیست محیطی دستگاه خردکن زباله های پزشکی نیز نیاز به آزمایش دارد. سهولت تمیز کردن محفظه خرد کردن و درگاه تخلیه، اثربخشی کنترل گرد و غبار و کاهش خطرات آلودگی ثانویه پس از خرد کردن زباله، همه از شاخص‌های مهم هستند. علاوه بر این، مصرف انرژی و صدای عملیاتی تجهیزات نیز باید در ارزیابی عملکرد گنجانده شود تا از انطباق با استانداردهای زیست محیطی و الزامات صرفه جویی در انرژی در هنگام پردازش زباله های پزشکی اطمینان حاصل شود.